Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copb2O55029 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copb2O55029 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Copb2O55029 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms