Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FxnO35943 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FxnO35943 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
FxnO35943 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
FxnO35943 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
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FxnO35943 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
FxnO35943 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
FxnO35943 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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FxnO35943 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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FxnO35943 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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FxnO35943 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FxnO35943 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FxnO35943 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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