Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RaxO35602 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RaxO35602 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RaxO35602 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RaxO35602 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RaxO35602 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RaxO35602 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RaxO35602 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RaxO35602 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RaxO35602 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RaxO35602 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RaxO35602 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms