Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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