Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kpna4O35343 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms