Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f3O35261 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms