Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq1O09165 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casq1O09165 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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