Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4340L7N2C4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4340L7N2C4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4340L7N2C4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4340L7N2C4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm4340L7N2C4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm4340L7N2C4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm4340L7N2C4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm4340L7N2C4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm4340L7N2C4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm4340L7N2C4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm4340L7N2C4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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