Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20878L7N244 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20878L7N244 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms