Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20939L7N243 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20939L7N243 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms