Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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