Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc180J3QNE4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc180J3QNE4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms