Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Top6blJ3QMY9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Top6blJ3QMY9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Top6blJ3QMY9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Top6blJ3QMY9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Top6blJ3QMY9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Top6blJ3QMY9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Top6blJ3QMY9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Top6blJ3QMY9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Top6blJ3QMY9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Top6blJ3QMY9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Top6blJ3QMY9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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