Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
E030018B13RikJ3QMS9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms