Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20834J3QM72 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms