Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21411J3KMS0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Gm21411J3KMS0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm21411J3KMS0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm21411J3KMS0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm21411J3KMS0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm21411J3KMS0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm21411J3KMS0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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