Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp17lcG5E8I7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp17lcG5E8I7 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp17lcG5E8I7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp17lcG5E8I7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp17lcG5E8I7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp17lcG5E8I7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp17lcG5E8I7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp17lcG5E8I7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp17lcG5E8I7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp17lcG5E8I7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp17lcG5E8I7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp17lcG5E8I7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp17lcG5E8I7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Usp17lcG5E8I7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp17lcG5E8I7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp17lcG5E8I7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp17lcG5E8I7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Usp17lcG5E8I7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp17lcG5E8I7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Usp17lcG5E8I7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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