Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer4aF8VPX6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms