Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Zfp988F6VKC7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Zfp988F6VKC7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Zfp988F6VKC7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Zfp988F6VKC7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Zfp988F6VKC7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Zfp988F6VKC7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Zfp988F6VKC7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Zfp988F6VKC7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Zfp988F6VKC7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Zfp988F6VKC7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Zfp988F6VKC7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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Zfp988F6VKC7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp988F6VKC7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp988F6VKC7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp988F6VKC7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp988F6VKC7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp988F6VKC7 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp988F6VKC7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp988F6VKC7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp988F6VKC7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp988F6VKC7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp988F6VKC7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp988F6VKC7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp988F6VKC7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp988F6VKC7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp988F6VKC7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp988F6VKC7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp988F6VKC7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp988F6VKC7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Zfp988F6VKC7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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