Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn5F6UCX4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms