Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm28305F6U473 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms