Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf169E9Q7F2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf169E9Q7F2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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