Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Pate1E9Q658 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Pate1E9Q658 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Pate1E9Q658 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pate1E9Q658 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pate1E9Q658 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pate1E9Q658 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pate1E9Q658 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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