Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 AC079245.1-201ENSMUST00000215680 1454 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3250E9Q1M3 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms