Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf11E9PZM7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scaf11E9PZM7 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms