Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc175E9PVB3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms