Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gcn1E9PVA8 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gcn1E9PVA8 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gcn1E9PVA8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gcn1E9PVA8 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gcn1E9PVA8 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gcn1E9PVA8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gcn1E9PVA8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gcn1E9PVA8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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