Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms