Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tmem238A9JSM3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tmem238A9JSM3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms