Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm6880A3KG45 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm6880A3KG45 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm6880A3KG45 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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