Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam43bA2AM80 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms