Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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Prdm16A2A935 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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Prdm16A2A935 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Prdm16A2A935 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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Prdm16A2A935 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm16A2A935 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms