Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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