Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms