Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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