Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Gpc6Q9R087 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Gpc6Q9R087 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Gpc6Q9R087 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Gpc6Q9R087 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Gpc6Q9R087 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Gpc6Q9R087 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Gpc6Q9R087 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Gpc6Q9R087 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Gpc6Q9R087 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Gpc6Q9R087 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpc6Q9R087 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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