Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rdh11Q9QYF1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms