Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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VapbQ9QY76 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms