Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Snai3Q9QY31 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms