Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdcQ9QW08 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms