Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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