Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
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SacsQ9JLC8 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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SacsQ9JLC8 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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SacsQ9JLC8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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SacsQ9JLC8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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SacsQ9JLC8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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SacsQ9JLC8 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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SacsQ9JLC8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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SacsQ9JLC8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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SacsQ9JLC8 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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SacsQ9JLC8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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SacsQ9JLC8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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SacsQ9JLC8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
SacsQ9JLC8 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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