Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Nectin3Q9JLB9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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