Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms