Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl39Q9JKF7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms