Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trem1Q9JKE2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms