Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SelenofQ9ERR7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms