Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc28a3Q9ERH8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Slc28a3Q9ERH8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms