Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MesdQ9ERE7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MesdQ9ERE7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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