Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tspan4Q9DCK3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tspan4Q9DCK3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tspan4Q9DCK3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Tspan4Q9DCK3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Tspan4Q9DCK3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Tspan4Q9DCK3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms